ขณะที่พวกของโคนันไปดูสตูดิโอที่ตัดต่อภาพยนตร์ “หน้ากากไยบะ เดอะ มูฟวี่ II” ก็เกิดคดีฆาตกรรมขึ้นในระหว่างที่รอดูภาพยนตร์ที่เสร็จสมบูรณ์ และยังมีคนลึกลับที่เฝ้าติดตามโคนันและไอบาระอยู่!! หรือว่าจะเป็นพวกบุรุษชุดดำขององค์กรลึกลับนั่น...!? แม้จะรู้ว่าอันตรายย่างกรายมาใกล้ แต่โคนันก็ยังไขคดีปริศนาต่อไป!!